Doktorat v evropski mreži MSCA DN LongTREC: kako nova generacija sekvenciranja RNA pomaga pri raziskavah rastlin pod stresom?

LongTREC (Long-reads Transcriptome European Consortium) je evropska doktorska mreža programa Marie Skłodowska-Curie, v katerem se 12 doktorskih študentov v vodilnih evropskih laboratorijih (vključno z našim iz NIB) usposablja za delo z najnovejšimi tehnologijami sekvenciranja posameznih molekul RNA. Te tehnologije nam omogočajo, da namesto kratkih koščkov preberemo celotne transkripte/mRNA (zapise za posamezne beljakovine), kar bistveno izboljša razumevanje, kateri transkripti v celici dejansko nastajajo in kako se to spreminja v času in ob stresu. Na Nacionalnem inštitutu za biologijo sem mentor doktorski študentki, ki te pristope uporablja pri raziskavah odziva rastlin na abiotski stres. Predstavil bom delo na tem projektu od laboratorija do rezultatov računalniške analize, in kakšno prednost predstavlja takšno internacionalno sodelovanje.